Компанія Google у середу офіційно представила AlphaGenome 2 – інноваційну модель, що здатна прогнозувати вплив варіацій ДНК на різні типи клітин людини. Ця розробка надає науковцям новий інструмент для виявлення клітинних причин виникнення хвороб.
Технологічні особливості моделі
Система інтегрує генетику людини та біологію окремих клітин, перетворюючи статичні атласи на прогностичну платформу. AlphaGenome 2 є умовною моделлю, яка аналізує специфічні відмінності в імунних чи серцевих клітинах без необхідності повторного навчання. Вона базується на даних понад 100 мільйонів профілів окремих клітин.
Ключові переваги для досліджень
- Ідентифікація вдвічі більшої кількості причинних варіантів ДНК.
- Визначення спрямованих ефектів генів.
- Відновлення відсутніх даних через міжмодальне прогнозування.
- Точне картографування зв’язків між енхансерами та цільовими генами.
Інструмент допомагає пов’язати результати повногеномних асоціативних досліджень (GWAS) із конкретними типами клітин, де розвивається патологія. Модель дозволяє встановити, чи певний варіант ДНК пригнічує активність гена, чи навпаки підвищує її.
| Параметр | Опис можливостей |
|---|---|
| База навчання | Понад 100 мільйонів клітинних профілів |
| Тип моделі | Умовна (conditional) модель |
| Функціонал | Міжмодальне прогнозування та аналіз енхансерів |
Доступність та майбутні перспективи
Наразі AlphaGenome 2 та навчальні матеріали Colab відкриті для некомерційних наукових цілей через AlphaGenome API. Комерційні розробники можуть скористатися режимом приватного попереднього перегляду. У майбутньому функціонал з’явиться на платформі Google Antigravity як AlphaGenome 2 Skills.
Дослідницький підрозділ Google DeepMind, що входить до складу Alphabet Inc., продовжує утримувати лідерство у сфері ШІ для біології. Раніше компанія розробила систему AlphaFold, яка прогнозує структуру білків та допомогла отримати Нобелівську премію з хімії 2024 року.
Метод GWAS, з яким працює нова модель, дозволяє шукати зв’язки між генетичними варіантами та ризиками захворювань. Проте раніше головною проблемою залишалося встановлення причинно-наслідкового зв’язку, оскільки більшість варіацій розташовані в не кодуючих ділянках геному. AlphaGenome 2 покликана розв’язати це завдання, поєднуючи глибоке навчання з експериментальною біологією.
Джерело: Інтерфакс-Україна
